Vụ án giết người hàng loạt xảy ra ở 3 thành phố Tokyo, Osaka, Kyoto. Để làm sáng tỏ vụ án, Conan và Heiji đã tức tốc đến Kyoto! Đúng lúc ấy, một nhân vật bí ẩn được cho là thủ phạm đã xuất hiện trước mặt hai người!! Chân tướngcủa vụ án nổi lên một cách đáng ngờ dưới gốc cây anh đào trong đêm!!